Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALPK3Q96L96 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK3Q96L96 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK3Q96L96 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms