Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TPD52L3Q96J77 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPD52L3Q96J77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TPD52L3Q96J77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms