Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITCHQ96J02 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms