Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYFIP2Q96F07 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYFIP2Q96F07 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYFIP2Q96F07 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYFIP2Q96F07 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYFIP2Q96F07 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYFIP2Q96F07 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYFIP2Q96F07 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYFIP2Q96F07 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYFIP2Q96F07 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYFIP2Q96F07 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms