Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGF29Q96ES7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGF29Q96ES7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms