Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL38Q96DV4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL38Q96DV4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms