Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDF1Q96CC6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHBDF1Q96CC6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms