Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS3Q969F9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS3Q969F9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms