Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIFAP3Q92845 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIFAP3Q92845 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIFAP3Q92845 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms