Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSC1Q92574 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSC1Q92574 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms