Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMPDL3AQ92484 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPDL3AQ92484 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPDL3AQ92484 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms