Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL1Q8WXF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL1Q8WXF7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms