Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJA4Q8WW22 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DNAJA4Q8WW22 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms