Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCFD1Q8WVM8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCFD1Q8WVM8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCFD1Q8WVM8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms