Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC12Q8WUD4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC12Q8WUD4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms