Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB2BQ8WUD1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms