Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK9Q8TD19 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms