Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC9Q8NEP7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC9Q8NEP7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms