Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF248Q8NDW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF248Q8NDW4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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