Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBOF1Q8ND07 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBOF1Q8ND07 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms