Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC63Q8NA47 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC63Q8NA47 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms