Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MFSD2AQ8NA29 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms