Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DTX3Q8N9I9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DTX3Q8N9I9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DTX3Q8N9I9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms