Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF1Q8N6C5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF1Q8N6C5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms