Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA5B2Q8N398 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms