Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJD3Q8N144 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD3Q8N144 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms