Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPUSD2Q8IZ73 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPUSD2Q8IZ73 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms