Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00523Q86TU6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00523Q86TU6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms