Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE2Q1Q7Z7E8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2Q1Q7Z7E8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms