Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC46A3Q7Z3Q1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC46A3Q7Z3Q1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC46A3Q7Z3Q1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC46A3Q7Z3Q1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC46A3Q7Z3Q1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC46A3Q7Z3Q1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC46A3Q7Z3Q1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms