Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC29A4Q7RTT9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC29A4Q7RTT9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms