Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX7Q7RTT5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX7Q7RTT5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms