Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPCAT2Q7L5N7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms