Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMIM5Q71RC9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMIM5Q71RC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms