Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00114Q6XXX2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00114Q6XXX2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms