Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NSMFQ6X4W1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms