Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.8 ms