Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BLOC1S2Q6QNY1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BLOC1S2Q6QNY1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BLOC1S2Q6QNY1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BLOC1S2Q6QNY1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BLOC1S2Q6QNY1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BLOC1S2Q6QNY1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms