Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FBXO42Q6P3S6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO42Q6P3S6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms