Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC42EP5Q6NZY7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP5Q6NZY7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC42EP5Q6NZY7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms