Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN13Q6MZZ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms