Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDE2Q6IQ49 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms