Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCSAPQ6IQ19 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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