Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPPQ6IPU0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CENPPQ6IPU0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPPQ6IPU0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms