Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CREB3L3Q68CJ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CREB3L3Q68CJ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms