Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E4F1Q66K89 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E4F1Q66K89 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E4F1Q66K89 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms