Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WSCD1Q658N2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WSCD1Q658N2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WSCD1Q658N2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms