Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1DP3Q658K8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EEF1DP3Q658K8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1DP3Q658K8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms