Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGAP9Q5VTM2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP9Q5VTM2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP9Q5VTM2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms