Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HES3Q5TGS1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HES3Q5TGS1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HES3Q5TGS1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HES3Q5TGS1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HES3Q5TGS1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HES3Q5TGS1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HES3Q5TGS1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HES3Q5TGS1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms